Le Comede se donne pour missions d’agir en faveur de la santé des exilés et de défendre leurs droits. L’association a en particulier pour objectifs :
de leur assurer des soins et un soutien médical, psychologique, social et juridique dans les cas où ceux-ci sont inexistants ou inadéquats et d’agir en leur faveur ;
de favoriser leur accès aux soins, à la prévention et aux droits ;
de faciliter tout ce qui peut permettre leur plus grande autonomie et leur meilleure insertion ;